Seu acervo é constituído de dois grupos distintos de cepas: linhagens padrão utilizadas no controle de qualidade e produção de antígenos e antissoros; e cepas selecionadas para inclusão em face de características feno e/ou genotípicas relevantes. Esta seleção é resultante da realização de estudos básicos e aplicados em espécies das famílias Enterobacteriaceae, Vibrionaceae e Aeromonadaceae, bem como outros grupos bacterianos de importância na patologia humana, saúde animal, meio ambiente, com relevância em Saúde Pública.
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