A pesquisa é uma atividade estratégica para o Observatório de Museus e Centros Culturais. O programa de pesquisa do OMCC propõe a elaboração de protocolos de pesquisa que possam ser utilizados por diversas instituições museais. Estas pesquisas, aplicadas em diferentes museus, geram bases de dados que permitem comparar o que acontece nestas instituições atualmente e também formar séries históricas, seja, acompanhar no tempo como evolui o que se quer observar, como por exemplo, o perfil dos visitantes e das visitas, o perfil e a natureza da formação do profissional que trabalha nos museus, entre outros focos de interesse. Além de construir protocolos  para a produção de dados primários, o OMCC apóia e desenvolve pesquisas a partir de fontes secundárias, analisando dados produzidos por outras instituições, documentação arquivística e bibliográfica.